『花は枯れるか飛ぶ』の意味は
『枯れる』は主人公と恋人が地に堕ちる。
『飛ぶ』は幸せな未来にタンポポの綿毛のように飛ぶ。
という意味です。
妄想でごめんなさい(笑)

追記:『花』主人公と恋人が『そこ』にあるという意味です。
(ノベルゲーだとして)
水を得られるかどうかは、プレイヤーが決めるという……
(語彙が限界)

修正しました